原发性三叉神经痛的病因及发病机制尚不清楚，但多数认为其病变在三叉神经的周围，即在三叉神经半月节感觉根内。根据显微外科和电镜观察，可能与小血管畸形、岩骨部位的骨质畸形等因素有关，而引起疼痛发作。

1、按病因分类：根据病因是否明确，分为原发性三叉神经痛与继发性三叉神经痛两类。

(1) 原发性三叉神经痛(特发性三叉神经痛)：临床上把找不到确切病因的三叉神经痛称为“原发性三叉神经痛”。以往认为占临床的大多数，是三叉神经分布区域内的发作短暂性剧烈疼痛，是无器质性损害可寻到的一种疾病。多见于40岁以上的中老年人,达70%～80%，最小年龄只有十几岁，最高年龄92岁。男女发病比数各家报道有所不同，据一份国内15家医院1454例统计，男多于女，其中男788例，女666例。国内另一组4386例三叉神经痛发病情况，女性多于男性，为3∶2。

(2)继发性三叉神经痛(症状性三叉神经痛)：是指由颅内外各种器质性病变引起的三叉神经继发性损害而致的三叉神经痛。多见于40岁以下的病人。与原发性三叉神经痛的不同点是：疼痛发作时间通常较长，或为持续性、发作性疼痛，而无扳机点。体格检查可查出三叉神经受累的客观表现及原发性疾病的体征，但亦可完全为阴性者。经CT、MRI检查一般可明确诊断。