因盆腔器质性疾病导致的，如盆腔炎症、肿瘤或子宫内膜异位症引起。

子宫内膜异位症为痛经的常见原因，少数妇女亦可以子宫颈狭窄(继发于锥形切除，冷冻或电灼)，子宫肌腺病引起，疼痛发生于子宫试图将组织从宫颈口排出时，一个有蒂的粘膜下肌瘤或一个内膜息肉从子宫排出时，有时引起痉挛性疼痛。盆腔炎症可引起下腹部广泛的，持续的疼痛，并在经期趋于加重。另有其他类痛经原因不明。