巧克力色痰为血和脓的均匀混合物，见于阿米巴肺脓肿。阿米巴肺脓肿(amoebic lung abscess)，属于肠外阿米巴病(extraintestinal amoebiasis)，少见，大多数是由阿米巴肝脓肿穿过横膈直接蔓延而来，少数为阿米巴滋养体经血流到肺所形成。脓肿多位于右肺下叶，常为单发，由于横膈被穿破，故肺脓肿常与肝脓肿互相连通。脓肿腔内含咖啡色坏死液化物质，如破入支气管，坏死物质被排出后可形成空洞。临床上患者有类似结核的症状，咳出褐色脓样痰，其中可检见阿米巴滋养体。