在便秘的诊断和鉴别诊断中，根据临床需要，应做必要的检查。首先要注意有否存在报警症状及全身其他器质性病变存在的证据。对50 岁以上、有长期便秘史、短期内症状加重患者应进行结肠镜检查以排除大肠肿瘤的可能。对于长期滥用泻剂者，结肠镜可确定是否存在泻剂性结肠(cathartic colon) 或(和) 结肠黑变病，钡剂灌肠造影有助于先天性巨结肠的诊断。如疑为OOC 、肛门指诊、排粪造影均是必须的。特殊的检查方法包括:胃肠通过试验(gastrointestinal transit test, GITT) 、直肠及肛门测压(anorectal anometry, RM) 、直肠- 肛门反射检查、耐受性敏感性检查、气囊排出试验(balloonexpulsion test, BET) 、盆底肌电图、阴部神经潜伏期测定试验及肛管超声检查等，这些检查只在难治性便秘时选择。