临床观察乳头内陷多半是先天性畸形，也有后天的原因如乳头乳房感染(乳腺炎)，外伤，肿瘤，手术造成(巨乳缩小整形术后)。先天性乳头内陷常由于乳头及乳晕内的平滑肌发育不良。乳头包含10-20根乳腺管的开口，乳腺管的周围是有乳晕肌肉延伸的平滑肌包裹。而平滑肌伸至乳头的真皮，这些肌束向内牵拉导致乳头内陷。也有些是由乳腺管发育不全，乳腺管未能导管化，而是一实心条索牵拉。有些是乳头深层缺乏支持组织。