肾动脉栓塞的栓子90%来源于心脏，血管阻塞的原因可能是来自远方的栓塞，如心房颤震合并有左心房小血块，感染性心内膜炎造成细菌性血栓等。它也可导因于原位性的血管疾病，如动脉粥状硬化，创伤后的血肿压迫，或是血管炎等。肾栓塞多为单侧，但约有15%到30%可能两侧同时发生。