除了先天原因外，炎症、损伤和手术疤痕是主要原因。输尿管口损伤狭窄，狭窄愈完全患侧腰痛，有时可触及积水的肾脏并发感染时有畏寒发热或脓尿双侧输尿管狭窄可出现尿毒症表现，愈接近肾脏，对肾脏的损害出现得愈早，程度也愈重。最终将导致肾功能丧失。为了保护肾功能免受损害，肾毒性较大的药物禁用或慎用。