美国疾病控制与预防中心评估了以下的9种综合症，都是与胎儿酒精综合症有重叠的特征，但没有一种包括了所有3种胎儿酒精综合症的面部特征，且都不是因生前酒精暴露而引起的：

阿尔斯科格氏综合征

威廉氏综合症

鲁能综合症

杜波威兹氏综合症

达量雅综合症

甲苯综合症

胎儿乙内酰脲综合征

胎儿丙戊酸综合症