吞咽障碍容易与如下症状混淆：

仰颈时吞咽困难：食管压迫型颈椎病早期症状，表现为仰颈时吞咽困难，屈颈时则消失。食管压迫型颈椎病又称吞咽困难型颈椎病，在临床上相对少见。　

吞咽痛：咽部炎症的表现，初起时咽部干燥，灼热，继而疼痛，吞咽时尤其明显。　

吞咽发呛：正常人类的吞咽反射弧上某个环节受损伤时，就会发生吞咽困难。吞咽困难的患者有的会因被吞咽的食物误入气管而导致吞咽发呛。患者频繁出现吞咽呛咳症状即可诊断。

吞咽困难：正常吞咽功能发生障碍时称为吞咽困难，即食物从口腔至胃运过程中受到阻碍的一种症状，可由咽部、食管或喷门的功能或器质性梗阻引起。患者进食后即刻或8~10秒钟内在咽、胸骨后或剑突后粘着、停?或哽塞感。

吞咽时胸痛：食管炎、食管裂孔疝、弥漫性食管痉挛、食道肿瘤引起的胸痛常于吞咽时发作或加剧。