腘窝囊肿有原发与继发两种。原发型起于关节腔而关节本身是正常的，多为双侧，但不一定同时发病，切除后有复发倾向。继发型常继发于关节的某些病变，最多见的是骨关节病，类风湿性关节炎，以及与半月板有关的膝内紊乱，特别是与半月板后面病变有关系。