引起肛门痛疼的疾病可根据其引起痛疼的原因不同，分为两类。

(1)肛门痛疼与排便有关者：

肛裂、绞窄性内痔、肛隐窝炎、血栓性外痔。

(2)肛门痛疼与排便无关者：

肛门周围感染、肛管癌。

还有少数肛门痛疼是由异物引起，有人误食鸡骨、鱼刺、带壳的瓜子，也有个别情况异物是由肛门推入。