当肠内菌群失调，使各种细菌在肠内发酵，产生了大量的气体，使得胃肠内内容物产生幅度过大，或超出常规的移动，所以就会出现肠鸣。也就是通常所说的肠亢进。

《内经》肠鸣有五：一曰脾虚，腹满飧泄，食不化，二曰中气不足，肠为之苦鸣，三曰邪在大肠，肠中雷鸣，气上冲胸，;四曰土郁，即《内经》“土郁之发，肠鸣而为数后”，用半夏、木香、茯苓;五曰热胜，腹中肠鸣，气上冲胸。《金匮要略》有里寒肠鸣，腹中寒气，雷鸣切痛，胸胁逆满呕吐。李东垣治胃寒泄泻，肠鸣，用益智、半夏、生姜、大枣。朱丹溪治胃中水火相激腹鸣，用黄芩、黄连、山栀。《张氏医通·大小府门》谓：肺移寒于肾为“涌水”，其证按腹不坚，水气客于大肠，疾行则鸣，濯濯如囊裹浆水之病。