代谢性或中毒性病因：实际上任何代谢性疾病都可能引起谵妄，在老年人中，药物不良反应是最为常见的病因。冬季要注意一氧化碳中毒，急慢性酒精中毒、食物中毒(毒蕈类、肉毒杆菌等)，工业中毒(汞、苯)。

结构性病因：可以激发谵妄的结构性病变包括脑血管闭塞与脑梗死、蛛网膜下腔出血、原发的或转移性脑肿瘤、硬膜下血肿以及脑脓肿。大多数结构性病变都能被CT或MRI查出，而且许多病变都能产生局灶性神经体征，在进行体检时就能被观察到。

感染性病因：可以引起谵妄的感染性病因有急性脑膜炎或脑炎或脑外的各种感染，后者可能通过毒素的产生或导致发热引起谵妄。肺炎(甚至不伴有供氧障碍者)、尿路感染、败血症或病毒感染引起的发热，在易受伤害的大脑中，都可以引起精神错乱。发展较慢的脓肿或机会性感染临床诊断比较困难，在某些病例中可能需要脑组织活检来正确判定。