腭部穿孔需要做如下鉴别。

1、鼻恶性肉芽肿活动期：鼻通气不畅或完全阻塞，有脓涕，常有臭味。全身情况尚可，出虚汗，食欲较差，常有低热，少数有高热，用一般抗生素治疗无效。局部检查见鼻粘膜肿胀，糜烂以至溃疡，呈肉芽状，表面有灰白色坏死。多先累及下鼻甲或鼻中隔，明显者可致鼻外部膨胀隆起，病变发展可造成鼻中隔穿孔或腭部穿孔。

2、鼻咽结核：常表现为粘膜溃疡或肉芽肿形成，患者可有鼻塞、流涕、听力减退等，可于病理检查中确诊。口咽及喉咽结核主要有粟粒型或溃疡型两种，粟粒型咽结核常继发于严重的肺结核(如粟粒型肺结核等)有明显的全身中毒症状，咽痛剧烈，可向耳部放射，严重影响吞咽。咽部粘膜苍白，软腭，腭弓或咽后壁等处可见多数散在的粟粒大结节，以后迅速发展为浅表溃疡，边缘不整齐，表面被覆污秽渗出物，溃疡型咽结核好发于腭弓或咽后壁，一处或数处不等，发展较慢，溃疡亦可向深部发展，致软腭穿孔，腭弓或悬雍垂缺损，愈合后遗留疤痕性狭窄或畸形。

3、软腭癌晚期：可出现吞咽困难，并产生声音改变，软腭固定、破坏、穿孔可导致食物返流至鼻腔;向上或向外侵犯鼻咽或咽旁间隙可有牙关紧闭、张口困难、中耳炎、颞部疼痛及偶尔颅神经受累。