分离性身份障碍的症状可能有变化或减轻，但疾病本身不会自发缓解。药物会有助于缓解某些症状，但对疾病本质不起作用。所有成功的治疗都是使用针对分离性身份障碍的特殊心理治疗，促成病人人格的整合。有些病人不愿意或拒绝人格整合，对于他们，治疗目标应放在促成病人各种人格间的协调性和合作性上，以减轻症状。这种治疗十分艰巨和痛苦，各种人格间的相互作用暴露出病人所面临的危机，而病人对创伤性的记忆会感到痛苦。一次或多次住院可以帮助病人渡过困难时期，或者渡过其痛苦回忆时期。催眠可以用来了解各种人格特征，促成彼此间的沟通，使得它们协调平稳。催眠也用来发掘创伤性经验，减轻它们的消极影响.有时眼球运动失感觉和重新恢复试验(EMDR)是一种有效的方法。他使病人回忆起创伤性经验。并将对自我的负性思维替代为积极的思维。

如果要达到将病人的人格整合，促成其和谐统一，恢复正常功能，完全消除症状的治疗目标，一般需要每周至少两次，持续3~6年的心理治疗。而人格整合是最为理想的治疗结果。

心理治疗有三个主要阶段。第一阶段是加强安全感，稳定感，使病人足够坚强，面对创伤性经验和人格问题。对人格系统的发掘是为了计划以后进一步治疗。第二阶段，帮助病人回忆痛苦的经历，将对丧失和创伤的痛苦体验表达出来。当病人分离性症状原因被解除后，治疗进入最后阶段。这时对病人的自我，人际关系和社会功能进行连接，整合和修复。有些整合可以自发实现，但大多数需要对人格进行重新组合和构筑，或者必须借助想象和催眠促成。整合完成后，病人还必须对其余留进行治疗。整合后的治疗十分必要，治疗次数虽有所减少，但不能完全停止。病人会将精神科医生看做能帮助他们解决心理问题的人，一如他们定期寻求内科医生的帮助一样。，