作鉴别诊断时要除外几种遗传性结缔组织病的特征和Marfan综合征、Ehlers-Danlos综合征、风湿热和一些少见的代谢紊乱性疾病，如高胱氨酸尿症也可有关节松弛，但本综合征是指单独存在全身关节松弛。

Marfan综合征：Marfan综合征是一种结缔组织广泛异常的遗传性疾病，主要累及眼、骨骼和心血管系统，为常染色体显性遗传。高龄双亲的小孩本综合征的发生率明显增多。其主要特征是双侧性晶状体脱位、细长指(趾)和细长体型，可有心脏异常和青光眼等。

Ehlers-Danlos综合征：先天性结缔组织发育不全综合征是由Ehlers(1901)与Danlos(1908)提出，指有皮肤和血管脆弱，皮肤弹性过强关节活动过大3大主症的一组遗传性疾病。

高胱氨酸尿症：

高胱氨酸尿症或称同型胱氨酸尿症(homocystinuria)又称假性Marfan综合征，是含硫氨基酸代谢病之一为常染色体遗传性代谢性疾病，突变基因可能位于2号染色体短臂，首先由Carson和Neill以及Gerritsen等(1962)分别报告。发病率为2.5/10万～5/10万活婴，本病除引起骨骼异常及眼部病变，可引起血管和脑病变，儿童脑卒中应排除本病的可能。