由于浅层点状角膜炎是非特异性的，根据临床从原发病鉴别。浅层点状角膜炎是非特异性的，常见于下列疾病：干眼症，睑缘炎，暴露性角膜病变，眼睑皮肤松弛综合症等。浅层点状角膜炎在临床上比较常见且其特性各不一样。
现将其诊断依据分裂如下：
1、葡萄球菌性的角膜炎：常伴发于慢性结膜炎，集中在角膜下1/3。为针尖大小皮点状糜烂，呈极细的点状、椭圆或圆形高出上皮的浸润病灶。
2、红眼性角膜炎：多位于瞳孔区角膜上皮或上皮下呈点状浸润，大小不均。
3、单疱性上皮型角膜炎：上皮下点状和线状浸润很快发展成树树状。
4、春季结膜炎性角膜炎：多半发于春季结膜炎，点线状上皮剥脱满布于整个角膜上。
5、沙眼性角膜炎：位于角膜上端、沙眼血管翳末端的上皮及上皮下浸润、糜烂及浅溃疡。
6、表层点状角膜炎：荧光素染色在角膜瞳孔区有聚焦状的针尖大小细点状上台着色。
7、药物诱发性角膜上皮炎：均匀分布在角膜全表面细点状混浊，有用药点眼史。
