颞叶癫痫：偶可出现强迫观念和行为，呈发作性，并有其它颞叶癫痫的症状，脑电图、脑电地形图等检查可助鉴别。

广泛性焦虑症：广泛性焦虑与强迫症在过度忧虑上就有很多相似之处，但是，与强迫思维内容不一样，过度性忧虑，其忧虑的具体内容一般在现实生活中存在，而且病人并不认同自己的忧虑是不合适的(自我协调ego syntonic)，它们不会觉得它们不应该担心那些事情。而强迫思维的内容一般是虚构的，而且对这些想法病人认为是不合适的(自我不协调 ego dystonic)，他们认为不应该出现这些念头。除此之外，广泛性焦虑障碍病人和强迫症病人都会担心他们日常的一些事情，比如担心他们的孩子会生病，广泛性焦虑障碍病人会担心由于生病导致的长远的后果(比如学习退步，身体衰弱等等)，而强迫症患者则会注意疾病的病菌(比如他们的孩子身上的感冒病毒会大批滋生)。对于那些没有强迫动作，只有强迫思维的患者，尤其要区分忧虑与强迫思维。

恐惧症：如果不考虑仪式行为，特定的恐惧症和强迫症是很相似的。比如说，对细菌和老鼠的病人常常能够通过成功回避老鼠来降低焦虑，但是，对于强迫症病人来说，如果他带有“老鼠病毒”的强迫思维，虽然老鼠已经走了，他仍然会感觉受到细菌的感染，即便是在知道某个地方只是在几个小时前出现老鼠的情况下，也会感觉被感染。这些问题通常会导致病人随后采取回避性行为(比如大洗衣服。洗澡等)。这些行为通常在特定的恐惧症病人身上不会发生。