柯萨奇病毒属于小核糖核酸病毒科的肠道病毒属。病毒颗粒为球形或卵圆形，直径为22～30nm，呈圆形颗粒状。病毒基因组为单股线状RNA，全长约6000～8500bp，构成病毒核心。外壳呈20面体，立体对称，由32个壳粒组成，每个壳粒含有病毒核酸编码的四种壳蛋白VP1～VP4。在5号核酸端结合一个病毒基因蛋白Vpg，在Vpg之后接着一段长约740bp的非编码区。柯萨奇病毒按照在乳鼠中病变的不同而分为A、B两组。A组原有24个血清型，其中第23型后来被划归艾柯病毒9型，尚存23个血清型。这些血清型皆可用中和试验和补体结合试验加以区别。A组病毒虽不具有共同的抗原，但有型间的交叉免疫性，如A3和A8、A11和A15、A13和A18之间可有交叉血清反应;相反，在6个B组病毒的血清型和A9之间，则有共同的群抗原。除少数毒株外，柯萨奇病毒不产生红细胞凝集素，因而不能采用血凝抑制试验来鉴定。

柯萨奇病毒对新生小白鼠有高度致病性，A组病毒引起骨骼肌广泛性肌炎和弛缓性瘫痪而于1周内死亡。B组病毒可引起灶性分布的肌炎，并可引起脂肪组织炎、脑炎、心肌炎、胰腺炎、肝炎和心内膜炎。乳鼠常出现全身震颤、痉挛和强直性瘫痪。较年长的小白鼠可耐受B组病毒感染，但可通过使用肾上腺皮质激素而诱发胰腺炎。营养不良可使B3病毒在成年小白鼠中产生严重疾病，包括在心、脾、肝、脑中的持续性感染，淋巴组织萎缩。将有免疫力的小白鼠淋巴细胞转移至营养不良小白鼠体内，可保护该小白鼠抵抗B3病毒，防止严重后果的产生。A7、A9和A16病毒亦可在猴肾细胞培养中生长，某些A组毒株可在人羊膜细胞、Hela细胞或RD细胞株中生长，但A1、A19和A22病毒则未能在任何细胞培养中繁殖。猩猩和猴子感染后可不发病，病毒在咽部和血液中短暂出现，并通过粪便排出持续2～5周之久。

A14病毒在成年小白鼠和猴子中引起脊髓灰质炎样病变，A7病毒在猴子中则引起严重中枢神经系统病变和瘫痪。在细胞培养中，B组病毒可引起细胞病变。受染细胞变圆，皱缩，胞核固缩、反光，最后退化而脱落。A组病毒不产生细胞病变。