1、早期尿道旁腺癌应与尿道肉阜区别，对有怀疑恶变的尿道肉阜，均应做活检以明确诊断。

2、中、晚期的尿道旁腺癌应排除原发病灶是否来自前庭，但前者为腺癌，后者为鳞状细胞癌。

尿道旁腺癌根据临床表现的症状和体征可初步做出诊断;经行尿道口肿物活检为腺癌时可确诊。病人从出现症状到确诊的时间可能数天，也可能长达数年，一般为3～12 个月，少数情况下，患者可无任何症状，她们往往为检查其他疾病而偶然发现患有尿道癌。