代谢性或感染性疾病可通过血液成分的改变或直接的毒素的存在抑制大脑半球和脑干的功能。脑血流量的减少(如晕厥或严重心力衰竭)或脑的电活动的改变(如癫痫发作)也都能造成意识障碍。脑震荡，抗焦虑药物以及麻醉剂可以引起意识障碍而不伴有可被察觉的脑部结构性变化。造成意识障碍的病因往往不是立刻就清楚的，诊断有赖于采取有序的步骤。首先，要保障病人的呼吸道通畅，检查血压与脉搏，进行心电图检查，以明确心脏输出是否充足。