深部性头痛的患病部位大都在头部，其所属科室是内科、神经内科，与之相关的疾病有脑脓肿 、头痛 、脑膜炎、脑积水、脑膜瘤、颅中窝脑膜瘤、脑室内脑膜瘤。深部性头痛多见于脑脓肿、脑炎、脑肿瘤，并向同侧外部放射。

该病可能出现的相关症状有搏动性头痛、抽搐、癫痫性头痛、钝痛、多梦、恶心、乏力、反复发作性头痛。