肾活检是明确诊断的唯一方法指征。包括诊断不能肯定或肾衰进展，肾小球通常是正常的最早期表现是间质水肿典型。随后出现间质淋巴细胞浆细胞嗜酸性细胞和少量嗜中性白细胞浸润，严重病例中可见炎性细胞侵入衬在小管基底膜的细胞间空隙(小管炎)，在其他标本中可能见到继发于甲氧苯青霉素磺胺类药分枝杆菌和真菌的肉芽肿反应，非干酪样坏死性肉芽肿的存在提示结节病免疫荧光或电镜很少能显示病理学特征变化。