脂肪痢只是一种症状，医生会为病人进行血液测试，评估病人的营养状况，以及进行测试了解吸收不良的状况。按病人的不同情况，医生会进行不同的检查包括放射性检验、内窥镜或活组织检查。医生须先透彻了解病况，针对不同的潜在问题配以合适的治疗方案。

对于乳糜泻的患者，停止摄取小麦和黑麦的蛋白质(即不含麸质的饮食)后便会恢复，正常;而小肠受细菌感染的病人在接受抗生素治疗后，亦会停止出现脂肪痢;胰，分泌出现问题的病人在摄取胰?酵素后亦会好转，这种酵素若经胃酸中和，就会失去效用，因此病人可服用肠溶片，药丸在经过胃部后才释放酵素。

患有脂肪痢的病人应控制脂肪的摄取。由于我们需要一定份量的脂肪以助人体成长和发展，所以病人可从日常饮食中摄取另类脂肪，称为中链叁酸甘油脂(也叫作中链脂肪酸)。中链叁酸甘油脂有别于其他脂肪，可透过其他渠道被肠道吸收，因而避免出现脂肪痢的症状。