(1)免疫性肾炎：免疫性肾炎多发生于心内膜炎发病后数周，符合免疫反应发生的机制，表现为不同程度的镜下或肉眼血尿，蛋白尿，红细胞管型，轻至中度急性肾炎综合征伴氮质血症比较常见，血尿素和肌酐升高，肌酐清除率下降，也有报道肾脏有广泛新月体形成，临床呈急进性肾炎表现，部分病人可出现低蛋白血症和肾性水肿，而肾病综合征少见，常见广泛而严重的肾损害，可发生肾衰。

(2)小管间质性肾炎：感染性心内膜炎引起间质肾炎与感染病原菌经血循环进入肾实质引起间质肾炎及长期使用大量抗生素有关，使用抗生素尤其是青霉素类，会导致过敏性小管间质肾炎，其临床表现与其他药物相关性小管间质性肾炎类似。

(3)肾脓肿：急性葡萄球菌性心内膜炎同时伴有全身的脓毒败血症时可同时导致肾脏多发性小脓肿，临床表现为发热，腰痛，肾区叩击痛，可出现血尿。