不明原因发热的诊断关键在找出病因，临床上主要应鉴别4 类疾病，即感染性疾病、恶性肿瘤、自身免疫性疾病及其他可引起发热的疾病。不明原因发热的研究文献中的方法并不适用于日常临床工作,，其原因有病历来自不同的地区、开展研究的机构不同(如社区医院、教学医院、流动诊疗所) 、不明原因发热的患者亚群不同等等。尽管有这些影响因素存在，感染仍是不明原因发热研究性报告中最为普遍的病因。