急型需同急性心肌炎,急性心肌梗塞,急性胃炎,胆道蛔虫症鉴别。

慢型需同扩张型心肌病(DCM),围产期心肌病,冠心病,心包炎(慢性)及风心病鉴别。

亚急型需同急,慢性肾小球肾炎或肾病,支气管肺炎(合并心衰),心内膜弹力纤维增生症,心包炎鉴别。

潜在型需同局灶性心肌炎,肥厚型非梗阻性心肌病,心脏神经官能症鉴别。

缺硒在动物可引起白肌病，在人类环境中的硒及人体的硒负荷水平与克山病的发病具有一定的相关性。给病区人群补充一定量的硒可降低克山病的发病率。另外硒在动物实验中已证实具有抗多种致癌物质的作用。但过量的硒可引起硒中毒，出现脱发、脱甲等。