急性细菌性前列腺炎由于其临床表现明显和典型，易做出诊断;慢性前列腺炎综合征的临床特点变异较大，且不确切，许多症状、体征和病理学检查在慢性细菌性前列腺炎、非细菌性前列腺炎和前列腺痛中经常无法鉴别，放射学和尿道膀胱镜检查，对诊断可能有一些帮助，但也不能肯定诊断。

前列腺组织学检查只在一些少见类型的前列腺炎，如肉芽肿型前列腺炎才需要。在慢性细菌性前列腺炎组织学改变对确定炎症为细菌病因并无特异性，1组连续162例前列腺增生手术切除，发现前列腺炎症发病率98%。观察到有6种明确的炎症形态学类型，但前列腺细菌感染培养阳性和阴性无明显差异。大多数病例炎症反应是局灶性的，仅累及整个前列腺的小部分，因此前列腺活检在前列腺炎处理上很少有指导意义。前列腺活检标本组织培养对慢性前列腺炎诊断价值很小。