脑神经麻痹约有四分之一是原因不明，其中一半会自动复原。而糖尿病、高血压、血管硬化，常是形成脑神经麻痺的主要原因，需针对上述疾病加以检查治疗。而外伤也常造成第四对和第六对脑神经麻痺，其他如脑压升高、肿瘤、发炎、病毒感染都有可能造成脑神经麻痹，需做进一步的检查才能确定。而对于脑神经麻痹所造成的斜视，可以遮盖一眼解决复视的问题，在观察半年后仍未恢復，再考虑手术治疗。